吸收：口服给药后，阿巴卡韦的吸收迅速而充分。成年人口服阿巴卡韦的绝对生物利用度约为83%。口服给药后，阿巴卡韦血浆浓度的平均达峰时间(tmax)，片剂约为1.5小时，口服溶液约为1小时。片剂和溶液的AUC之间没有差异。治疗剂量(300mg，每日2次)下，阿巴卡韦片剂的稳态Cmax约为3mg/mL，在给药间隔为12小时的情况下，AUC约为6mg/h/mL。口服溶液的Cmax值比片剂稍高。
进食延迟了吸收并降低了Cmax，但并没有影响总体血浆浓度(AUC)。因此，本品在进食时或不进食时均可服用。
分布：静脉给药后，表观分布容积约为0.8L/kg，表明阿巴卡韦可自由地向组织内穿透。对HIV感染病人的研究表明，阿巴卡韦能很好地穿透至脑脊液中，脑脊液与血清AUC的比值在30-44%之间。以每日600mg，分2次给予阿巴卡韦时，观察到的浓度峰值比阿巴卡韦的IC50即0.08mg/mL或0.26mM大9倍。
体外血浆蛋白结合的研究表明，治疗浓度时，阿巴卡韦与人血浆蛋白仅呈低、中度结合(约49%)。这表明通过血浆蛋白转换作用引起这些药物与其它药物发生相互作用的可能性很低。
代谢：阿巴卡韦主要由肝脏代谢，服用剂量中约2%以原型经肾脏清除。本药在人类的主要代谢途径是经乙醇脱氢酶和葡萄糖醛酸化作用将剂量中约66%的药物生成5'-羧酸和5'-葡萄糖苷酸经尿排出。
清除：阿巴卡韦的平均半衰期约为1.5小时。以300mg，每日2次的剂量多次口服后，阿巴卡韦无明显的蓄积。阿巴卡韦的清除首先是经肝脏代谢，随后代谢产物主要经尿排出。尿中的代谢产物和原形物占阿巴卡韦剂量的83%，其余通过粪便清除。
特殊人群
肝损害：阿巴卡韦主要经肝脏代谢。安全性的分析数据支持轻度肝损伤病人服用阿巴卡韦300mg，1日2次。尚无中度肝损伤病人推荐服用阿巴卡韦的支持性资料，因此上述病人应避免服用本品，对于严重肝功能受损的病人，本品禁止使用。
肾损害：阿巴卡韦主要由肝脏代谢，约2%的阿巴卡韦以原形经尿排泄。晚期肾病患者和肾功能正常者的药代动力学相似，因此肾损伤病人不必减量。由于经验有限，晚期肾病患者应避免服用本品。
儿童：根据在儿童中进行的临床试验，阿巴卡韦口服溶液吸收迅速而充分。儿童的总体药代动力学参数与成人相似，但血浆浓度的差异较大。在临床试验中，3个月至12岁儿童所用的剂量为8mg/kg，每日2次。推荐阿巴卡韦用于儿童的安全性资料尚不充足。
老年病人：阿巴卡韦的药物动力学研究尚未在65岁以上的病人中进行。
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