对新冠肺炎进行疫情相关人群筛查时，主要方法是检测口腔拭子中的核酸，因为方便快捷，适合大规模筛查。鼻咽拭子检测新冠肺炎核酸的准确性高于口咽拭子，但人体感觉不舒服。在去年的检测中，发现很多感染者喉咙里的核酸转阴后，肛拭子检测仍然是阳性，而且持续的时间更长。核酸检测的结合可以提高检出率，降低漏诊比例。但肛拭子采样不方便，不适合社区大规模筛查检测。
对于一些无症状或轻度感染者，感染后病情恢复很快，3 ~ 5天咽核酸检测不出来。通过研究发现，部分感染者粪便或肛拭子核酸阳性持续时间长于上呼吸道。因此，增加肛拭子核酸检测可以提高感染者的检出率，减少漏诊。核酸检测虽然具有灵敏度高、检测周期短的优点，但也存在一些缺点。与直接从人体中分离活病毒的方式不同，核酸检测是一种间接的方式，可能会造成假阴性。
由于试剂盒存在最低检测限的问题，所以只有当采集样本中的病毒含量达到一定水平时，才能检测出来。少数情况下，康复者可能无法康复，但由于样本中病毒载量较低，康复者的核酸检测结果为阴性，也就是我们常说的“假阴性”。
因此，在《新型冠状病毒诊疗规范(试行第七版)》中，出院标准之一是痰、鼻咽拭子等呼吸道样本核酸连续两次为阴性(采样时间间隔至少24小时)。之所以选择呼吸道标本进行核酸检测，是因为新冠肺炎属于呼吸道传染病，所以首选从呼吸道分泌物中获取标本。呼吸道分为上呼吸道和下呼吸道。前者主要包括鼻、咽、喉。后者主要包括气管、主支气管和肺内支气管。据此，现在在疑似患者中检测到病毒核酸，采集的标本一般有两类，即上呼吸道标本和下呼吸道标本。
如何在肛拭子试验中取样
1.将棉签浸泡在生理盐水中，插入2-3厘米长的肛门内，从肛门周围的褶皱处擦拭，或在肛门内轻轻旋转，然后插入装有生理盐水的试管中。
2.对于粪便拭子培养，上述所有操作都需要使用无菌设备，并将拭子放入无菌试管中。